王爷见林子医术高明，十分喜欢林子，便认了林子做义子。利用林子的医术便想把贵族们都拉拢过来。于是，给林子找了个清幽之地，便住在王府的后院。而林子所住之地都是医书，林子闲时便喜欢坐在亭子里的石凳上看书。
这日，明珠端着莲子汤来看林子，见林子钻心苦读，便放下莲子汤欲要离去。林子放下书正想打盹，忽见有人影闪过，忙抬起头见是明珠，便叹道：“好妹妹你大日头里，送来这个，身体刚好些，万一晒伤了怎使得？”明珠笑道：“林子哥哥每日都苦读书，我过来看看哥哥，随便送来了莲子汤。哥哥尝尝看味道可好？”林子道：“多谢妹妹挂念着，只是让那些丫头送来就是了，万一再病了怎么是好呢？学这些也没感觉苦，反觉得乃苦尽甘来。若不懂医术怎会与妹妹相识相知呢。”说到这。林子便知多言了，不由得脸红。明珠见林子这般说十分喜欢，便含笑道：“林子哥哥治好我的病，送这些也是应该的，若我再病了会有哥哥为我医治的，我何必担心这些？”
林子道：“好妹妹你若病了，哥哥会心疼的。”明珠见林子这般对她，十分开心。便坐在林子身边，慢慢地靠在林子的肩上林子唬了一跳，忙道：“好妹妹男女有别，万万不可的。”说着，忙站起来。明珠也跟着站起来，一下抱住了林子，便道：“林子哥哥我，我！喜欢你。”林子不忍心推开明珠，忙道：“我无父母，只是跟义父学医，我不过是个草民而已，怎配的上你金枝玉叶呢？”说着，欲要推开明珠。明珠反抱得更紧，哪肯放手。明珠道：“你难道对我没一点心动吗？”林子道：“妹妹乃貌美如花的，哪有男人看了不心动的？”明珠见他这般说来，喜上眉梢。林子见明珠云容月貌的，不由得蠢蠢欲动，虽想云尤雨殢，但也怕让人看见反到不好。明珠也知林子这个意思，便松开林子。
林子吓了一头冷汗来，又见四下无人，忙用袖子拭去上额的冷汗，这才放心。明珠道：“哥哥，咱们划船去可好？”林子看书也有些倦了，上船散散心岂不好？便高兴的同意了。二人便上了船。林子一面划船，一面赏荷花，感觉十分闲散安逸。林子见明珠眼笑眉舒，便把林子的魂勾去了。明珠将鱼食撒给小鱼儿，见它们吃食的情景十分开心。玩的不亦乐乎。林子越看越喜欢明珠。明珠玩累了，便把船上的帘子放下来，躺下来休息。林子见她含情脉脉地看着自己，早已无法忍受了，便云梦闲情来。事已完毕。
月色朦胧，二人便划船各自回屋去了。
且说，林子和明珠感情之事，王爷已知晓，便不理会这事，假装不知这事儿。林子和明珠虽好了一段时间，可好景不长。这天和明珠从小一起长大的大臣之子，张敏特来提亲。王爷满心欢喜地答应了，这门亲事并定好了迎娶的日子。明珠知道了这件事后，便哭着来找王爷道：“爹，我除了林子谁也不嫁。”王爷怒道：“婚姻大事岂能由得你，非嫁不可。”明珠哭道：“爹您最疼女儿了，今日怎就不依我了，若爹不疼女儿，那我就出家当尼姑去。”说着，便哭着回屋去了。
这可把王爷急坏了，不知如何是好？明珠的妹妹明玉对张敏早就情有独钟。听姐姐说喜欢林子，心里十分开心。也知爹最疼姐姐的，心里感觉委屈。今日姐姐这般说来正合她的心意。明玉便说：“爹，姐姐既想出家，不如随她便是，我明日嫁张敏，爹你看可好？”王爷一听十分喜欢道：“你姐姐被我惯坏了，还是你乖这样你不委屈吗？”明玉笑道：“能为爹分担些，也是女儿该做的事儿。”王爷听了十分满意。
次日，明珠便真的出家当尼姑了，而明玉便顺理成章的嫁给了张敏。王爷为讨好皇帝，便把林子送到太医院去。临行前一晚，林子便来尼姑庵探望明珠。二人便泪汪汪的，林子不忍看明珠这般形象便伤心地离去了。林子便来到太医院。但对明珠乃念念不忘，便放在心里，尽量把精力放在治病救人上。空闲时林子心想：“既不能与明珠长相厮守，不如弄些女孩儿的衣裳放在密室中，感觉明珠就在家中一般。”想到这。又想：“虽说太医院好，可未必是长久之计，不如趁现在，多给自己弄些黄金白银，以后也不必为衣食而愁。万一出甚么事也好可溜之大吉，岂不妙？”想到这。便十分开心。
林子见每次都有漂亮的衣裳送进宫来，便欲买下来。一天公主也来挑衣裳，见太医林子在买衣裳，便笑道：“林子你买这些女儿衣裳做甚么？”林子道：“回公主的话。小的若有空探亲的话，想把这些衣裳送给远方的亲戚，姐姐妹妹们，让她们也穿得体面些。也可沾沾王宫的喜。”公主笑道：“没想到林子还有这番心思。”林子道：“让公主见笑了。”说着，便把几件衣裳拿回屋里去了。有些药材宫里是没有的，需林子亲自上山去采来。林子利用采药的机会把金银等带了出去，而每次都不多带怕招惹是非。林子神不知鬼不觉地把东西放进地窖藏好，乃无人知晓。就这样日积月累，也攒了不少积蓄。
可巧欣赏林子的皇帝驾崩了，太子便继位了。新皇帝便冷落了林子。林子感觉该是离开这个太医院的时候了。这日，林子便辞了官，收拾了几件旧衣裳就这样离去了。师父说完了他的经历。石闵二人都叹道：“师父如此聪明，只是没去看看明珠现在可好？”师父叹道：“都这些年了，我也看淡了，人也老了不如让这些事过去罢！”闵月芯道：“师父，明珠却有情有义的，不能就这么放弃，有机会还是要争取的，或许王爷也离开人世了。你又离开了皇宫太医院了，已是自由之身，师父又有了这些财物，自然苦不了明珠的，不如明日就起身，把明珠接来，也不枉费她对你的一片痴情才是呢。”闵月芯的话语激活了师父那颗沉睡了多年的心灵。
石诚宇道：“师父，就是王爷还在，或许也想明白了，自然也懒得去管这些事儿了。”闵月芯道：“诚哥哥说的对，不管真假去查明才好。”师父听了，石闵二人的一番言语，心里明朗了许多，便同意明日出发。大家便各自回屋休息去了。次日清晨，师徒三人便上路了。闵月芯打扮成小童的样子，而他们则打扮成地主的样子。来至尼姑庵，众尼姑见他们是来烧香的施主，便引导到施恩箱旁，石诚宇放了许多烧香钱。
林子道：“请师父，把净空大师请来。”师父道：“请施主稍等，我这就去叫她来。”说着，便去了。不一会儿，果然是明珠来了，大家便坐好。小尼姑忙倒茶，茶倒好便退去了。石闵二人怕有人来，便守在门外。林子道：“明珠，让我好想你。”明珠恍然大悟这才抬头见不是别人正是自己朝思暮想的人儿。二人站起来抱在一起，是欣慰还是开心所有的感想都融合在一起。二人不知说甚么才好，只是抱着对方痛哭流涕的，一句话也说不出来。明珠泣诉道：“哥哥我以为今生再也无法见到你了。”林子叹道：“我心里一直挂念你，想也不可能我们再相见的，多亏两个好徒儿劝说的，我才有勇气来见你的，看来甚么事没有绝对的，只要有生命就会有奇迹出现的。我现在也有钱了，你可以幸福的和我生活在一起了，我们隐居山上你看可好？”明珠乐道：“只要和你在一起我去哪也无所谓的。”说着，便让石闵二人进来。
天色已暗。趁尼姑们吃饭时，明珠便女扮男装，大家便匆匆离开尼姑庵，坐上马车远去了。次日，大家发现净空师父不见了，明珠因是王爷之女，想是回王府去了，也都不理论此事了。大家回到山上，已是清晨，明珠便换了衣裳，无心休息到处走走看看。见山上鸟语花香的十分喜欢。便说：“哥哥，我爹一直想让我回王府，可我不愿回王府，他也无奈，后来爹失望了也就不来看我了。我慢慢地习惯了这尼姑庵的生活了。但心里还是想着你。谁知，等你还是等到了。”说着，林子便搂着明珠说：“明珠你知道吗？我给你买了好多衣裳和首饰，这样我总是感觉你在我身边，我也就知足了。”明珠含笑点头。二人说着忙回屋内去了。
石闵二人忙给师父和师娘，贴喜字，点龙凤喜烛等。师父和师娘拜完天地便入洞房去了。